对于跨境电商发展来说，物流是保证商品在全球市场自由流通的保障。目前我国的跨境物流存在着诸多问题：首先，是成本高的问题。我国物流成本一直占GDP总量的15%以上，相比于发达国家的10%以下，这个数据明显高于发达国家，物流成本居高不下成为跨境交易面临的最大“瓶颈”问题。其次，跨境物流系统不发达，没有形成一条完善的电商物流供应链体系。在信息流、资金流、物流、用户流等整个供应链体系中，跨境物流处于核心环节，但现实是物流并没有融入到进整个体系之中，甚至与其他环节是割裂的。目前，我国跨境物流多以第三方物流模式为主，52.8%的商户要依赖于国外的物流分配中心，零售商品的物流多以小包业务靠邮政渠道和依赖国际上的快递公司来实现。这些公司占据了70%的国际快递市场份额。国际物流业正向着信息化、综合型和一体化方向发展，但我国物流业目前却存在着成本高，效率低及服务不到位等问题。跨境物流主体较为分散，缺乏有实力大公司主导，对于零售物流来说，物流配送速度慢、时间长、全程追踪监督能力差、退换货难度大、跨境包裹破损甚至丢包等问题突出。除自身这些问题外，跨境物流的清关障碍是另一个制约因素，在通关过程中，由于各国海关政策不同，对进出境货物审查也不同，有些国家海关申报手续繁琐、申报时间长，同时费用支出也非常高，商品被滞留导致消费者无法按时收货。真正实现跨境交易与购物便捷迅速高效，提高物流企业内功和海关效率是需要解决的根本问题。